プラグインはすでに初期化されています

org.bukkit.plugin.InvalidPluginException: Plugin already initialized!

サーバーが、すでに読み込まれているプラグインを読み込もうとしました。

原因

1. plugins 内に同じプラグインのファイルが2つある：Plugin-1.0.jar と Plugin-1.1.jar。これが最も一般的な原因です。古い方を削除してください。
2. /reload — リロードコマンドです。このエラーをはじめ十数種類のエラーを引き起こし、宙に浮いたハンドラーやメモリリークを残します。
3. プラグインが .jar ではなくフォルダに展開されている。

/reload について

稼働中のサーバーでは /reload や /reload confirm を絶対に使用しないでください。これは以下の原因となります：

• メモリリークと Metaspace — OutOfMemoryError；
• アイテムの複製 — Dupes；
• イベントハンドラーの二重登録；
• 原因の特定が不可能な奇妙なエラー。

正しい方法は、サーバーを完全に再起動することです。1週間トラブルを抱えるよりも、数秒で済みます。

確認

/plugins

一覧にプラグインが2回表示される、または異なるバージョンで表示される場合は、重複の直接的な証拠です。